A Társulási Tanács a legfőbb döntéshozó szerv, tagjait a 42 települési önkormányzat polgármestere alkotja. Valamennyi polgármestert a település méretétől függetlenül 1 szavazat illet meg. A Tanács a munkáját az éves munkaterv alapján végzi, általában havi rendszerességgel ülésezik, működését a Szervezeti és Működési Szabályzat határozza meg. Döntéshozatalára jellemző, a kettős többség, amely azt jelenti, hogy a határozatképesség, az egyszerű és minősített többség meghatározásában a szavazatszámon kívül figyelembe veszi, hogy a leadott szavazatok a kistérséghez tartozó települések összlakosságának mekkora arányát képviselik. (Pécs M.J.Város jelenléte a határozatképesség függvénye.)